危険な場所の色地面の黄色は少しずつ体力が減る場所、赤は大きく減る場所。左上の小さな記号（温・pH・塩・O₂・UV・毒・乾）は、いる場所の各要素。緑は平気、黄は少しダメージ、赤は大ダメージ。↑は高すぎ、↓は低すぎ。
移動ドラッグ／クリック長押しで進む。キーボードはWASDか矢印キー。
捕食緑の輪は食べられる相手。赤の輪は自分より大きい捕食者。触れたら即座に食べられる。スペースでダッシュ。
進化と制覇縄張りがエリアの15%・30%・45%に届くたびに小進化して、次の姿を選べる。ライバル勢力の長と手下をすべて倒して全滅させるとボス（その時代の王）が現れ、倒せばその時代を制して輪廻転生できる。ボスは時代ごとに倒し方が違う（縄張りに誘い込む、背後をとる、鎧を割る、卵をつぶす、疲れさせる など）。現れたときのヒントと、ボスの体力バーの横の表示を見よう。食べるほど体は大きくなり、機能を取り込める。
環境と適応場所ごとに温度・pH・塩分・酸素・紫外線・毒ガス・乾燥が違う。火山、湧水、塩湖、洞窟などの地形が濃度を変える。適応範囲の外にいると体力が減る。範囲は特性と突然変異で広がるが、相性があり、高温に強くなると低温に弱くなる。ミニマップをタップすると危険度や各濃度に切り替わる。
ライバルライバル種の縄張りは、その種の性質（酸性、アルカリ性、毒、熱、乾燥、酸欠など）に染まっている。耐性があれば平気で、なければダメージを受ける。排泄で上書きして奪える。
小進化と突然変異小進化では、戦闘に強い「戦闘型」と、その時代の環境に強い「環境適応型」のどちらかを選ぶ。それぞれ2つの強化がつくが、次の時代には引き継がない。子孫が生まれると突然変異も起きる。
分裂と有性生殖微生物の時代は、繁殖ゲージが満ちると分裂して自動で子孫が生まれる。動物が現れるエディアカラ紀からは有性生殖になり、ゲージが満ちたら同じ種の異性（ピンクの輪とハート）を探して触れると、子が生まれる（双子のことも）。遺伝子が混ざるので、そのたびに突然変異が起きる。
遺伝子水平伝播能力をもつ生き物を食べると、まれにその遺伝子が入りこみ、能力を取り込むか選べる。鞭毛ダッシュ・吸い込み・殻・煙幕・飛び道具・穴に潜るはボタン（Qキー）で使い、擬態・ねばる軸足・刺胞・尻尾切り・群れはいつも効く。
命とセーブ1つの時代で命は3つ。3回死ぬとゲームオーバーで、その時代の最初からやり直し。進み具合は自動でセーブされ、タイトルの「続きから」で再開できる。
大量絶滅各時代で一度、実際の大量絶滅をもとにした大災害が起きる（縄張り30%か、しばらく時間がたつと）。10秒の予告のあと18秒間、排泄を2回以上重ねた濃い縄張りか巣の中にいないと数秒で力尽きる。生き延びると突然変異を得る。
図鑑メニューの「図鑑」に、食べた生き物・倒した王・生き延びた大量絶滅が記録される。遊び直しても残る。
中和最初の巣のまわりは完全に安全。それ以外の土地は、縄張りにしないと最低でも黄色（約10秒で力尽きる）。排泄を重ねるほど環境が中和され（1回で4割、3回で完全）、厳しい時代ほど何度も重ねる必要がある。食べると少し回復する。
縄張りと繁殖食べると排泄し、そこが縄張りになる。後から排泄した者がその場所の持ち主。縄張りの環境は、元の環境と持ち主が好む環境の中間になる（自分の縄張りは過ごしやすく、敵の縄張りは敵の性質に寄る）。繁殖ゲージが満ちると子孫が自動で生まれ、自分で食べて縄張りを広げる。縄張りに入った敵は弱っていく。同じ場所に何度も排泄すると縄張りが濃くなり（色が濃く見える）、敵に与えるダメージが最大3倍になる。敵の縄張りも同じで、濃いところほど受けるダメージが大きい。
生き物の能力2つ目の時代から、生き物はそれぞれ実際の化石や研究をもとにした能力を持つ。名前ラベルで確認でき、はじめて食べると豆知識が出る。刺胞（触れると刺す）、ねばる軸足（くっつくと遅くなる）、穴に潜る、尻尾切り、ジェット推進、丸まる なども。吸い込み（近くのものを引き寄せる）、殻にこもる（ダッシュで割る）、鞭毛ダッシュ・急発進（急に逃げる）、墨噴射・砂煙（視界が暗くなり足が遅くなる）、毒液を吐く（飛んでくる毒をよける）、擬態（近づくまで見えにくい）、群れ（数匹で動く）。
有害な獲物頭の上に色の点がある生き物は、食べると害がある（緑＝毒：しばらく弱る、黄＝酸の体液：持久が尽きる、白＝トゲ：ダメージ）。輪がオレンジなら要注意。毒や酸に強い体、または守りが25%以上の硬い体になれば平気で食べられ、ふつうより栄養になる。
ミトコンドリア持久力の機能。1つ取り込むごとにスタミナ回復が30%速くなり、ダッシュのスタミナ消費も減る。長く走って逃げたり追いかけたりできる。
系統樹★の機能を集めればヒトへの本流へ。別の系統を選んでも、その系統のまま何時代も生き続けられる。ただし、いつか必ず大絶滅が訪れる。
メニューEsc／Pキーか右上の「メニュー」で一時停止。能力、得意・苦手な環境、系統樹を確認できる。